Ізолят сироваткового протеїну — це концентрат, пропущений через додатковий етап фільтрації: більше білка на мірну ложку і настільки мало лактози, що люди, у яких концентрат викликає здуття, зазвичай нормально його переносять. Амінокислотний профіль такий самий, як у концентрату, тож реальна різниця лише у відсутності кількох грамів вуглеводів і жиру, вищій ціні та кращій переносимості. З точки зору харчової цінності немає причин обирати ізолят, якщо концентрат добре засвоюється.