Wei-eiwitisolaat is concentraat dat een extra filtratiestap heeft ondergaan: meer eiwit per scoop, en zo weinig lactose dat mensen die opgeblazen raken van het concentraat het isolaat meestal wel verdragen. Het aminozuurprofiel is hetzelfde als dat van het concentraat, dus de enige echte verschillen zijn de paar ontbrekende grammen koolhydraten en vet, de hogere prijs en de betere verdraagbaarheid. Voedingstechnisch is er geen reden om het te verkiezen als het concentraat goed valt.