カゼインはもう一つの乳タンパク質で、胃の中で凝固するため素早く排出されず、数時間かけてアミノ酸が血中にゆっくりと供給される。そのため、長時間食事を取らない前――多くは夜――に摂るのが一般的だ。カゼインミセルにミネラルが結合しているため、カルシウムが豊富に含まれる。タンパク質1gあたりのロイシン量はホエイよりやや少なく、これはトレーニング直後の食事では意味を持つが、1日の総摂取量ではほとんど問題にならない。