Whey protein izolatı, ek bir filtrasyon aşamasından geçirilmiş konsantredir: ölçek başına daha fazla protein ve konsantreyle şişkinlik yaşayan kişilerin genellikle tolere edebileceği kadar az laktoz içerir. Amino asit profili konsantreyle aynıdır, bu yüzden gerçek farklar sadece eksik birkaç gram karbonhidrat ve yağ, daha yüksek fiyat ve daha iyi tolerans edilebilirliktir. Konsantre mideyi rahatsız etmiyorsa, besin değeri açısından izolatı tercih etmek için bir neden yoktur.