เวย์โปรตีนไอโซเลทคือคอนเซนเทรตที่ผ่านขั้นตอนการกรองเพิ่มเติม ทำให้มีโปรตีนต่อช้อนตวงมากขึ้น และมีแล็กโทสน้อยพอที่คนที่ท้องอืดจากคอนเซนเทรตมักจะทนรับได้ โปรไฟล์กรดอะมิโนเหมือนกับคอนเซนเทรตทุกประการ ความแตกต่างที่แท้จริงจึงมีเพียงคาร์โบไฮเดรตและไขมันที่หายไปเล็กน้อย ราคาที่สูงกว่า และการทนรับที่ดีกว่า ในแง่โภชนาการไม่มีเหตุผลที่ต้องเลือกไอโซเลทหากคอนเซนเทรตย่อยได้ดีอยู่แล้ว